El objetivo no consiste en reemplazar por completo la analítica de referencia. La espectroscopía NIR es una eficaz técnica para examinar muestras de forma rápida y confiable, evitando de este modo muchos análisis rutinarios. No obstante, aún se necesita un número reducido de análisis de referencia para desarrollar los modelos de calibración iniciales y comprobar periódicamente su rendimiento.

Si bien el número de parámetros que se pueden medir dentro de un modelo de calibración únicamente está limitado por la potencia de computación y la complejidad del análisis, lo habitual es analizar entre 15 y 30 propiedades al mismo tiempo.

En los instrumentos modernos, para la medición NIR resulta óptima una resolución de 8 cm^-1. Dado que las bandas espectrales NIR son relativamente anchas, una resolución más elevada no mejora los resultados de la aplicación NIR. Por el contrario, los espectros de mayor resolución poseen una relación señal-ruido más pobre en un tiempo de medición dado.